1、校设研究机构

山东大学产业经济研究所

山东大学公共经济与公共政策研究中心

山东大学反垄断与竞争政策研究中心

山东大学日本经济研究中心

山东大学博弈论与经济行为研究中心

山东大学规划与发展研究中心

山东大学美国经济研究中心

2、国际合作研究机构

亚太经济研究中心（与澳大利亚昆士兰大学经济学院合建）

日本经济研究所（与日本日本大学经济学部合建）

法律、经济与组织研究中心

3、合作研究机构

山东省卷烟发展战略研究中心

4、院设科研机构

美国经济研究所                         

跨国公司研究所             

银行治理研究中心           

保险市场研究所

证券投资研究所             

中欧经济与法研究所

品牌经济研究中心           

就业与社会保障研究中心  

房地产研究中心

规划与战略研究所

政治经济学研究所            

西方经济学研究所            

财政学研究所               

国际经济与贸易学研究所        

金融学研究所                  

国民经济学研究所            

区域经济学研究所            

数量经济学研究所             

世界经济学研究所              

劳动经济学研究所 

货币与金融经济研究所